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南京市第二醫院(江蘇省傳染病醫院，南京市公共衛生醫療中心），又名南京中醫藥大學附屬南京醫院，東南大學附屬第二醫院，同時掛牌南京市腫瘤醫院、南京市老年病醫院。由宋美齡基金會創建于1933年，是集醫療、教學、科研、預防為一體，以“精專科、強綜合、重防治、應突發”為特色的三級甲等醫院。醫院先后榮獲衛生部“全國衛生系統抗擊非典先進集體”、中組部“全國防治非典型肺炎工作先進基層黨組織”、國家衛生計生委“人感染H7N9禽流感疫情防治工作中表現突出單位”、“國家埃博拉出血熱疫情防控先進集體”等榮譽稱號。

醫院現分為鐘阜院區、湯山院區、南山院區三個院區，開放床位1955張。2019年門急診量57.45萬人次，出院病人3.24萬人次。現有在職職工1455人，其中衛技人員1294人，高級職稱人員252人，博士36人，碩士339人。有感染性疾病科1個國家臨床重點專科，感染性疾病學、傳染科、腫瘤科、婦產科、普通外科、肝病科、結核科7個江蘇省重點學科、專科，中西醫結合科1個江蘇省示范中醫科，腸道及其他傳染病科、檢驗科、醫學影像科、重癥醫學科4個南京市重點專科，中心實驗室1個南京市醫學重點實驗室，國家中醫藥管理局重點研究室1個。有江蘇省醫學領軍人才3人，省醫學重點人才2人，省“333”工程人才12人，江蘇省有突出貢獻中青年專家和拔尖人才8人，江蘇省“六大人才高峰”8人；南京市有突出貢獻中青年專家和拔尖人才6人。有南京中醫藥大學、東南大學、南京大學等高等院校博導、碩導共78人。近五年獲省、市級科研成果獎37項，承擔國家自然科學基金13項、國家科技重大專項10項、省部級科研項目30項，獲專利授權34項，編寫專著41部，發表SCI及中華、中文核心論文300余篇。